Alfonso Eduardo Márquez Chamorro
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Email: Solicitar correo
Perfil en ORCID: 0000-0002-8243-0404
Perfil en WOS: K-9362-2014
Perfil en Scopus: 36612081600
Perfil en Dialnet: 4209327

Grupo de Investigación: Ingeniería del Software Aplicada
Departamento/Unidad: Lenguajes y Sistemas Informáticos
Situación profesional: Profesor Titular de Universidad

Participa en los siguientes proyectos/ayudas en la US:

• Proyecto de investigación:
  • Sistema de gesTión de conformidAd mulTi-dominio basado en mashUpS (PDC2022-133521-I00 - Equipo de Investigación)
  • Inteligencia híbrida para desarrollar un soporte avanzado para la conformidad en procesos de negocio (PID2022-140221NB-I00 - Equipo de Investigación)
  • PERSEO: Mejorando la operación y mejora continua de procesos en servicios digitales por medio de la colaboración bot-humano (PID2021-126227NB-C21 - Equipo de Investigación)
  • ORCHID: Impulsando la transformación digital en la administración pública mediante contratos inteligentes (TED2021-131023B-C22 - Equipo de Investigación)
  • MEMENTO: HerraMiEntas software para la colaboración y toma de decisiones en procesos basados en el conociMiENTO (US-1381595 - Equipo de Investigación)
  • EKIPMENT PLUS: Mejora del rendimiento de procesos basados en conocimiento: Un enfoque empírico multidisciplinar basado en personas, equipos, software y datos (P18-FR-2895 - Equipo de Investigación)
  • Optimización de Servicios Basados en Conocimiento Usando Aplicaciones Basadas en Servicios (RTI2018-101204-B-C22 - Equipo de Investigación)
  • Propelling Business Process Management by Research and Innovation Staff Exchante (RISE_BPM) (H2020-645751 - Investigador)
  • Tecnologias para Servicios Cloud Híbridos, Altamente Configurables y Regulados por Ans (TIN2015-70560-R - Equipo Trabajo (Solicitud))
  • Copas: Ecosystems for Optimized Process As a Service (P12-TIC-1867 - Investigador)
  
  
• Contrato con empresas (Arts. 68/83 LOU):
  • CÁTEDRA DE INTELIGENCIA ARTIFICIAL US - GOOGLE (TSI-100930-2023-2 - Investigador)
  • PROSAS: Investigación y Desarrollo en el área de procesos de los Servicios Horizontales de Tecnologías de la Información y las Comunicaciones del Servicio (P015-15/E15 - Investigador)
  
  
• Actividades de Transferencia de Conocimiento:
  • TIRSO – Trustworthy infrastructures regulated by service level objectives (PYC20 RE 084 US - Equipo de Investigación)
  
  
• Ayuda a la investigación:
  • ANA: Automatización del gobierno confiable de infraestructuras reguladas por Acuerdos de nivel de servicio (CEI-21 - Investigador)
  • Incentivo al Grupo de Investigación TIC-205 (2017/TIC-205 - Investigador)
  
  

Cobertura de la base de datos de proyectos, véase aqui

Publicaciones:

Libros

Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo:
Protein Structure Prediction based on Evolutionary Methods. Saarbrücken, Alemania. LAP LAMBERT Academic Publishing. 2013. 204. ISBN 978-3-659-39348-8

Capítulos en Libros

Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo, Bacardit Peñarroya, Jaume, Aguilar Ruiz, Jesus Salvador:
An Efficient Decision Rule-based System for the Protein Residue-residue Contact Prediction. Pag. 592-597. En: IEEE Congress on Evolutionary Computation (CEC), 2013. IEEE. 2013

Asencio Cortes, Gualberto, Aguilar Ruiz, Jesus Salvador, Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo, Ruiz Sanchez, Roberto, Santiesteban Toca, Cosme E.:
Prediction of mitochondrial matrix protein structures based on feature selection and fragment assembly. En: 10th European Conference on Evolutionary Computation, Machine Learning and Data Mining in Computational Biology, EvoBio 2012. 2012

Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo, Divina, Federico, Aguilar Ruiz, Jesus Salvador, Bacardit Peñarroya, Jaume, Asencio Cortes, Gualberto, et. al.:
A NSGA-II Algorithm for the Residue-residue Contact Prediction. En: 10th European Conference on Evolutionary Computation, Machine Learning and Data Mining in Computational Biology, EvoBio 2012. 2012

Santiesteban Toca, Cosme E., Aguilar Ruiz, Jesus Salvador, Asencio Cortes, Gualberto, Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo:
Short-range interactions and decision tree-based protein contact map predictor. En: 10th European Conference on Evolutionary Computation, Machine Learning and Data Mining in Computational Biology, EvoBio 2012. 2012

Asencio Cortes, Gualberto, Aguilar Ruiz, Jesus Salvador, Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo:
A nearest neighbour-based approach for viral protein structure prediction. Vol. 6623. Pag. 69-76. En: 9th European Conference in Evolutionary Computation, Machine Learning and Data Mining in Bioinformatics, EvoBIO 2011. 2011. ISBN 978-3-642-20388-6

Asencio Cortes, Gualberto, Aguilar Ruiz, Jesus Salvador, Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo:
Prediction of protein distance maps by assembling fragments according to physicochemical similarities. Vol. 93. Pag. 271-277. En: 5th International Conference on Practical Applications of Computational Biology & Bioinformatics, PACBB 2011. 2011. ISBN 978-3-642-19913-4

Santiesteban Toca, Cosme E., Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo, Asencio Cortes, Gualberto, Aguilar Ruiz, Jesus Salvador:
A Decision Tree-Based Method for Protein Contact Map Prediction. Vol. 6623. Pag. 153-158. En: 9th European Conference in Evolutionary Computation, Machine Learning and Data Mining in Bioinformatics, EvoBIO 2011. 2011. ISBN 978-3-642-20388-6

Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo, Divina, Federico, Aguilar Ruiz, Jesus Salvador, Asencio Cortes, Gualberto:
Residue-residue Contact Prediction based on Evolutionary Computation. Vol. 93. Pag. 279-283. En: 5th International Conference on Practical Applications of Computational Biology & Bioinformatics, PACBB 2011. 2011

Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo, Divina, Federico, Aguilar Ruiz, Jesus Salvador, Asencio Cortes, Gualberto:
A multi-objective genetic algorithm for the Protein Structure Prediction. Pag. 1086-1090. En: Proceedings of the 11th International Conference on Intelligent Systems Design and Applications (ISDA),. 2011. ISBN 9781457716768

Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo, Divina, Federico, Aguilar Ruiz, Jesus Salvador, Asencio Cortes, Gualberto:
An Evolutionary Approach for Protein Contact Map Prediction. Pag. 101-110. En: Proceedings of the 9th European conference on Evolutionary computation, machine learning and data mining in bioinformatics. 2011. ISBN 9783642203886

Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo, Divina, Federico, Aguilar Ruiz, Jesus Salvador:
Evolutionary computation for the prediction of secondary protein structures. Pag. 1082-1087. En: Proceedings of the 2011 ACM Symposium on Applied Computing. 2011. ISBN 9781450301138

Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo, Divina, Federico, Aguilar Ruiz, Jesus Salvador:
Evolutionary Protein Contact Maps Prediction Based on Amino Acid Properties. Vol. 2. Pag. 303-310. En: Proceedings of the 6th international conference on Hybrid artificial. 2011. ISBN 9783642212215

Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo, Divina, Federico, Aguilar Ruiz, Jesus Salvador, Asencio Cortes, Gualberto:
Alpha helix prediction based on evolutionary computation. Pag. 358-367. En: Proceedings of the 5th IAPR international conference on Pattern recognition in bioinformatics. 2010. ISBN 9783642199134

Publicaciones en Revistas

Troya Castilla, Javier, Parejo Maestre, José Antonio, Sergio Segura, Gamez Diaz, Antonio, Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo, et. al.:
Flipping Laboratory Sessions in a Computer Science Course: An Experience Report. En: IEEE Transactions on Education. 2021. Vol. 64. Núm. 2. Pag. 139-146. 10.1109/Te.2020.3016593

Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo, Resinas, Manuel, Ruiz Cortés, Antonio:
Predictive Monitoring of Business Processes: A Survey. En: IEEE Transactions on Services Computing. 2018. Vol. 11. Núm. 6. Pag. 962-977. 10.1109/Tsc.2017.2772256

Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo, Resinas, Manuel, Ruiz Cortés, Antonio, Toro Bonilla, Miguel:
Run-time prediction of business process indicators using evolutionary decision rules. En: Expert Systems With Applications. 2017. (In press)

Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo, Aguilar Ruiz, Jesus Salvador:
Soft Computing Methods for Disulfide Connectivity Prediction. En: Evolutionary Bioinformatics. 2015. Vol. 2015. Núm. 11. Pag. 223-229. 10.4137/Ebo.s25349

Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo, Asencio Cortes, Gualberto, Santiesteban Toca, Cosme, Aguilar Ruiz, Jesus Salvador:
Soft computing methods for the prediction of protein tertiary structures: A survey. En: Applied Soft Computing. 2015. Vol. 35. Pag. 398-410. 10.1016/j.asoc.2015.06.024

Nepomuceno Chamorro, Isabel de los Angeles, Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo, Aguilar Ruiz, Jesus Salvador:
Building transcriptional association networks in Cytoscape with RegNetC. En: IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics. 2015. Vol. 12. Núm. 4. Pag. 823-824. 10.1109/Tcbb.2014.2385702

Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo:
Evolutionary Methods for Protein Structure Prediction. En: AI communications. 2014

Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo, Asencio Cortes, Gualberto, Divina, Federico, Aguilar Ruiz, Jesus Salvador:
Evolutionary decision rules for predicting protein contact maps. En: Pattern Analysis and Applications. 2014. Vol. 17. Núm. 4. Pag. 725-737. 10.1007/s10044-012-0297-3

Bacardit Peñarroya, Jaume, Widera, Pawel, Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo, Divina, Federico, Aguilar Ruiz, Jesus Salvador, et. al.:
Contact map prediction using a large-scale ensemble of rule sets and the fusion of multiple predicted structural features. En: Bioinformatics. 2012. Vol. 28. Núm. 19. Pag. 2441-2448. 10.1093/Bioinformatics/Bts472

Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo, Divina, Federico, Aguilar Ruiz, Jesus Salvador:
Protein Secondary Structures Prediction Based on Evolutionary Computation. En: Applied Computing Review. 2011. Vol. 11. Núm. 4. Pag. 17-25. 10.1145/2107756.2107758

Aportaciones a Congresos

Troya Castilla, Javier, Sergio Segura, Parejo Maestre, José Antonio, Del Río Ortega, Adela, Gamez Diaz, Antonio, et. al.:
Inviertiendo las clases de laboratorio en Ingeniería Informática: Un enfoque ágil. Comunicación en Jornada. XXV Jornadas sobre Enseñanza Universitaria de la Informática. . Murcia: Universidad de Murcia, Editum. Universidad de Murcia. 2019

Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo, Resinas, Manuel:
A Hybrid Reliability Metric for SLA Predictive Monitoring. Comunicación en congreso. 34th ACM Symposium on Applied Computing. Limassol, Chipre. 2019

Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo, Resinas, Manuel:
Does your accurate process predictive monitoring model give reliable predictions?. Comunicación en congreso. 16th International Conference on Service-Oriented Computing. Hangzhou Zhejiang, Anhui, China. 2018

Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo, Resinas, Manuel, Ruiz Cortés, Antonio:
Monitorización predictiva de procesos de negocio basada en modelos de predicción actualizables. Comunicación en Jornada. XIII Jornadas de Ciencia e Ingeniería de Servicios (Jcis 2017). La Laguna, Tenerife, España. 2017

Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo, Resinas, Manuel, Ruiz Cortés, Antonio:
Towards a general architecture for predictive monitoring of business processes. Comunicación en Jornada. XII Jornadas de Ciencia e Ingeniería de Servicios (JCIS). Salamanca, España. 2016

Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo, Asencio Cortes, Gualberto, Giráldez Rojo, Raúl, Troncoso Lora, Alicia:
Proyectos Dinámicos para el Aprendizaje en los Primeros Cursos de las Enseñanzas de Programación Informática. Comunicación en congreso. I Seminario Iberoamericano de Innovación Docente de la Universidad Pablo de Olavide. Universidad Pablo de Olavide. 2014

Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo:
MECoMaP: a Multiobjective Evolutionary Contact Map Predictor. Poster en Jornada. XII Symposium on Bioinformatics. cicCartuja, Sevilla (España). 2014

Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo, Divina, Federico, Aguilar Ruiz, Jesus Salvador:
Improving the efficiency of MECoMaP: a protein residue-residue contact predictor. Ponencia en Congreso. Congreso Iberoamericano de Reconocimiento de Patrones. Ciudad de la Habana, Cuba. 2013

Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo, Divina, Federico, Aguilar Ruiz, Jesus Salvador, Bacardit Peñarroya, Jaume:
An Efficient Decision Rule-based System for the Protein Residue-residue Contact Prediction. Ponencia en Congreso. Evolutionary Computation, 2013, CEC'2013, IEEE Congress on. Cancun - Mexico. 2013

Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo, Divina, Federico, Aguilar Ruiz, Jesus Salvador, Asencio Cortes, Gualberto:
Un Algoritmo Genético para la Predicción de Mapas de Contacto Basado en Propiedades de Aminoácidos. Comunicación en congreso. Workshop Español Sobre Extracción y Validación de Conocimiento en Bases de Datos Biomédicas: Evabio 11 . Tenerife, España. 2011

Asencio Cortes, Gualberto, Aguilar Ruiz, Jesus Salvador, Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo:
Predicción de Mapas de Distancias de Proteínas Basadas en Vecinos Más Cercanos. Comunicación en congreso. Workshop Español Sobre Extracción y Validación de Conocimiento en Bases de Datos Biomédicas: Evabio 11 . Tenerife, España. 2011

Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo, Divina, Federico, Aguilar Ruiz, Jesus Salvador:
Alpha Helix Prediction Based on Evolutionary Computation. Ponencia en Congreso. Pattern Recognition in Bioinformatics. Nijmegen, Paises Bajos. 2010. Pattern Recognition in Bioinformatics. 358. 367

Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo, Aguilar Ruiz, Jesus Salvador:
Definición de Umbral Mínimo para la Predicción de Estructura Secundaria de Proteínas. Comunicación en congreso. Congreso Español Sobre Tecnologías Lógica Difusa. Punta Umbría. Huelva. 2010

Márquez Chamorro, Alfonso Eduardo, Aguilar Ruiz, Jesus Salvador:
Marco de Referencia en la Calidad de la Predicción de Mapas de Contacto de Proteínas. Comunicación en congreso. XIII Conferencia de la Asociación Española para la Inteligencia Artificial. Universidad de Sevilla. 2009. II Workshop Español Sobre Extracción y Validación de Conocimiento en Bases de Datos Biomédicas: Evabio 2009. 3. 10