José Francisco Ruiz Pérez
Telefono: 650/406/457
Email: Solicitar correo
Perfil en ORCID: 0000-0002-0039-3524
Perfil en WOS: P-2830-2019
Perfil en Scopus: 7401444841
Perfil en Dialnet: 3248618
Otro enlace a Web de investigación: https://grupo.us.es/gomezherreroslab/gomezherreroslab/Home.html

Grupo de Investigación: Expresion Genica en Eucariontes
Departamento/Unidad: Bioquímica Vegetal y Biología Molecular
Situación profesional: Profesor Titular de Universidad

Responsable de los siguientes proyectos/ayudas en la US:

• Proyecto de investigación:
  • Bases Moleculares de la Formación de Translocaciones Cromosómicas Potencialmente Oncogénicas por Nhej. Papel y Regulación de las Polx Humanas (BFU2013-44343-P)
  • Bases Moleculares de Enfermedades Neurodegenerativas Ligadas a Acumulación Proteica: Papel de la Reparación de Roturas en el ADN (P11-CVI-7948)
  
  
• Ayuda a la investigación:
  • Descifrando nuevas funciones de DNA polimerasas humanas especiallizadas en replicacion y reparacion del DNA (PP2019-13269)
  • Bases moleculares de las translocaciones cromosomicas potencialmente oncogenicas (PP2018-10807)
  • Inestabilidad Genómica Asociada a Roturas en el DNA (PP2017-8488)
  
  

Participa en los siguientes proyectos/ayudas en la US:

• Proyecto de investigación:
  • Estudio de las bases moleculares de la inestabilidad genómica asociada a las topoisomerasas de DNA (PID2022-137143NB-I00 - Equipo de Investigación)
  • Roturas de ADN Asociadas a Replicación y Reparación por Recombinación de Genomas Eucarióticos (BFU2010-16372 - Investigador)
  • Bases Genéticas y Moleculares del Origen de la Inestabilidad Genomica en Eucariotas (P09-CVI-4567 - Investigador)
  • Inestabilidad genómica (CSD2007-00015 - Investigador)
  • Genómica Funcional de la Interconexión Transcripción -Transporte de ARN (P07-CVI-02549 - Investigador)
  • Bases genéticas y moleculares de la inestabilidad genómica y su relación con la biogénesis de los mRNPs de eucariotas (BFU2006-05260 - Investigador)
  • Bases genéticas y moleculares del origen de la inestabilidad genética en eucariotas (EXC/2005/CVI-624 - Investigador)
  • Collision or progression: DNA replication fork traversal and RNAPII transcription termitation (BIO2003-07172 - Contratado)
  
  
• Ayuda a la investigación:
  • Incentivo al Grupo de Investigación BIO-026 (2017/BIO-026 - Investigador)
  • Incentivo al Grupo de Investigación BIO-102 (2011/BIO-102 - Investigador)
  • Incentivo al Grupo de Investigación BIO-102 (2010/BIO-102 - Investigador)
  • Ayuda a la Consolidación del Grupo de Investigación BIO-102 (2009/BIO-102 - Investigador)
  • Ayuda a la Consolidación del Grupo de Investigación BIO-102 (2008/BIO-102 - Investigador)
  • Ayuda a la Consolidación del Grupo de Investigación BIO-102 (2007/BIO-102 - Investigador)
  • Ayuda a la Consolidación del Grupo de Investigación CVI-102 (2006/CVI-102 - Investigador)
  • Ayuda a la Consolidación del Grupo de Investigación CVI-102 (2005/CVI-102 - Investigador)
  
  

Cobertura de la base de datos de proyectos, véase aqui

Publicaciones:

Capítulos en Libros

Gómez González, Belén, Ruiz Perez, Jose Francisco, Aguilera Lopez, Andres:
Genetic and Molecular Analysis of Mitotic Recombination in Saccharomyces Cerevisiae. Vol. 745. Pag. 151-172. En: DNA Recombination. Methods in Molecular Biology. H. Tsubouchi. 2011

Publicaciones en Revistas

Ruiz Perez, Jose Francisco:
Yra1-bound RNA¿DNA hybrids cause orientation-independent transcription¿ replication collisions and telomere instability. En: Genes & Development. 2018. Vol. 32. Pag. 1-13. http://www.genesdev.org/cgi/doi/10.1101/gad.311274.117.

Ruiz Perez, Jose Francisco:
Pol¿ tumor variants decrease the efficiency and accuracy of NH. En: Nucleic Acids Research. 2017. https://doi.org/10.1093/nar/gkx625

Ruiz Perez, Jose Francisco:
Identificada una nueva vía de regulación en la reparación de roturas de doble cadena en ADN de células humanas. En: Genética Médica News. 2017. Vol. 4. Núm. 76. Pag. 17-19

Muñoz Galvan, Sandra, Garcia Rubio, Maria Luisa, Ortega, Pedro, Ruiz Perez, Jose Francisco, Jimeno Gonzalez, Sonia, et. al.:
A new role for Rrm3 in repair of replication-born DNA breakage by sister chromatid recombination. En: PLoS Genetics. 2017. Vol. 13. Núm. 3

Sastre Moreno, G., Pryor, J.m, Herrero Ruiz, A., Cortes Ledesma, Felipe, Blanco, L., et. al.:
Regulation of human Pol¿ by ATM-mediated phosphorylation during non-homologous end joining. En: DNA Repair. 2017. Vol. 51. Pag. 31-45. doi: 10.1016/j.dnarep.2017.01.004.

Ruiz Perez, Jose Francisco, Pardo, Benjamín, Sastre Moreno, Guillermo, Aguilera Lopez, Andres, Blanco, Luis:
Yeast pol4 promotes tel1-regulated chromosomal translocations. En: PLoS Genetics. 2013. Vol. 9. Núm. 7

Ruiz Perez, Jose Francisco:
Yeast pol4 promotes tel1-regulated chromosomal translocations. En: PLoS Genetics. 2013. Vol. 9. Núm. 7. Pag. 1-14. 10.1371/journal.pgen.1003656

Ruiz Perez, Jose Francisco, Gómez González, Belén, Aguilera Lopez, Andres:
Aid Induces Double-Strand Breaks At Immunoglobulin Switch Regions and C-Myc Causing Chromosomal Translocations in Yeast THO Mutants. En: PLoS Genetics. 2011. Vol. 7. Núm. 2

Ruiz Perez, Jose Francisco, Gómez González, Belén, Aguilera Lopez, Andres:
Chromosomal Translocations Caused by Either Pol32-Dependant or Independant Triparental Break-Induced Replication. En: Molecular and Cellular Biology. 2009. Vol. 29. Núm. 20. Pag. 5441-5454

Autores, Otros, Ruiz Perez, Jose Francisco, Al, Et:
Polymerase is Up-Regulated During the T Cell-Dependent Immune Response and Its Deficiency Alters Developmental Dynamics of Spleen Centroblasts. En: European Journal of Immunology. 2005. Vol. 35. Núm. 5. Pag. 1601-1611

Gonzalez Barrera, Sergio, Autor, Otro, Ruiz Perez, Jose Francisco, Autores, Otros, Blanco Davila, Luis:
Characterization of Sppol4, a Unique X-Family DNA Polymerase in Schizosaccharomyces Pombe. En: Nucleic Acids Research. 2005. Vol. 33. Núm. 15. Pag. 4762-4774

Ruiz Perez, Jose Francisco, Autores, Otros, Piris, Miguel A., Blanco Davila, Luis:
Overexpression of Human DNA Polymerase Mu (Pol Mu) in a Burkitt's Lymphoma Cell Line Affects the Somatic Hypermutation Rate. En: Nucleic Acids Research. 2004. Vol. 32. Núm. 19. Pag. 5861-5873

Autor, Otro, Ruiz Perez, Jose Francisco, Autores, Otros, Blanco Davila, Luis:
Review/Reseña: Are There Mutator Polymerases?. En: The Scientific World Journal. 2003. Vol. 3. Pag. 422-431

Ruiz Perez, Jose Francisco, Al, Et:
¿Lack of Sugar Discrimination by Human Pol ¿ Requires a Single Glycine Residue¿. En: Nucleic Acids Research. 2003. Vol. 31. Pag. 4441-4449

Autores, Otros, Ruiz Perez, Jose Francisco, Kunkel, T. A., Blanco Davila, Luis:
DNA Polymerase Lambda, a Novel DNA Repair Enzyme in Human Cells. En: Journal of Biological Chemistry. 2002. Vol. 277. Pag. 13184-13191

Ruiz Perez, Jose Francisco, Autores, Otros, Blanco Davila, Luis:
DNA Polymerase Mu (Pol ¿), a Candidate Hypermutase?. En: Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences. 2001. Vol. 356. Pag. 99-109

Autor, Otro, Ruiz Perez, Jose Francisco, Autores, Otros, Blanco Davila, Luis:
DNA Polymerase Mu (), Homologous to Tdt, Could Act As a DNA Mutator in Eukaryotic Cells. En: EMBO Journal. 2000. Vol. 19. Pag. 1731-1742

Autores, Otros, Ruiz Perez, Jose Francisco, Autores, Mas, Blanco Davila, Luis:
DNA Polymerase Lambda (Pol λ ), a Novel Eukaryotic DNA Polymerase With a Potential Role in Meiosis Mammalian Meiotic Polymerase. En: JMB: Journal of Molecular Biology. 2000. Vol. 301. Pag. 851-857

Aportaciones a Congresos

Ruiz Perez, Jose Francisco:
CRISPR-Cas, las herramientas del futuro en Biología. Otras ponencias divulgativas. PINT of SCIENCE 2017. Sevilla. 2017

Muñoz Galvan, Sandra, Garcia Rubio, Maria Luisa, Pardo, Benjamín, Ruiz Perez, Jose Francisco, Gómez González, Belén, et. al.:
New factor involved in recombination-mediated restart of broken forks. Ponencia en Congreso. Abcam-Mechanisms of Recombination 2016. Alicante, España. 2016

Ruiz Perez, Jose Francisco:
Regulation of human DNA polymerase lambda during NHEJ by ATM-mediated phosphorylation. Poster en Congreso. DNA Polymerases: from molecular function to human diseases. Biarritz. 2016

Ruiz Perez, Jose Francisco:
Regulation of human Pol¿ by post-translational modification. Ponencia en Congreso. DNA Polymerases: from molecular function to human diseases. Biarritz. 2016

Herrero Ruiz, A., Cortes Ledesma, Felipe, Ruiz Perez, Jose Francisco:
Regulación de la ADN polimerasa lambda humana (Pol¿) mediante SUMOilación durante la reparación del ADN. Poster en Congreso. XXXVIII Congreso de la Sociedad Española de Bioquímica y Biología Molecular. Valencia. España. 2015

Ruiz Perez, Jose Francisco:
Regulación de la ADN polimerasa lambda humana (Pol¿) durante la reparación de DSBs or NHEJ mediante fosforilación dependiente de DNA-PKcs. Ponencia en Congreso. XXXVIII Congreso de la Sociedad Española de Bioquímica y Biología Molecular. Valencia. España. 2015

Ruiz Perez, Jose Francisco:
Regulation of human DNA polymerase lambda during NHEJ by DNA-PK-mediated phosphorylation. Comunicación en congreso. IX Meeting of the Protein Structure and Function Network. Sevilla, España. 2015

Ruiz Perez, Jose Francisco:
Analysis of genetic instability in Mouse Embryonic Fibroblasts (MEFs) deficient in Polymerases lambda and mu. Poster en Congreso. Gordon Research Conferences on Mutagenesis. Girona. 2014

Ruiz Perez, Jose Francisco:
DNA-PK-Mediated Phosphorylation of Human Pol Lambda During NHEJ. Ponencia en Congreso. Gordon Research Conferences on Mutagenesis. Girona. 2014

Ruiz Perez, Jose Francisco:
Yeast PolX DNA polymerase (Pol4) promotes NHEJ-dependent chromosomal translocations after DSBs induction. Poster en Congreso. Recombination Mechanisms and Genome Instability. Jerez, Spain. 2012

Ruiz Perez, Jose Francisco:
A role for PolX DNA polymerases in NHEJ-mediated chromosomal translocations. Poster en Congreso. The enemy within: Endogenous DNA damage as a source of cancer and ageing. Baeza, España. 2011

Ruiz Perez, Jose Francisco:
A role for PolX DNA polymerases during NHEJ-mediated chromosomal translocations. Comunicación en Jornada. 5th Consolider Meeting. Barcelona, España. 2011

Ruiz Perez, Jose Francisco, Gómez González, Belén, Aguilera Lopez, Andres:
R-Loop Dependant Transcription Impairment Can Result in Dsbs and Chromosomal Translocations in Yeast. Poster en Congreso. Embo Conference Series on Recombination and Connections to Sumo and Ubiquitin Modifications. Il Ciocco, Italia. 2010. Embo Conference Series on Recombination and Connections to Sumo and Ubiquitin Modifications. 0. 0

Ruiz Perez, Jose Francisco, Aguilera Lopez, Andres:
DSB-Induced Chromosomal Rearrangements. Conferencia Congreso no publicada. Embo Conference Series on Recombination Mechanism. Il Ciocco, Italia. 2008. Embo Conference Series on Recombination Mechanism. 0. 0

Gavaldá Martín, Sandra, Ruiz Perez, Jose Francisco, Aguilera Lopez, Andres:
Analysis of Replication Fork Collisions With the Transcription Machinery. Comunicación en congreso. SEBBM XXXI Congreso Sociedad Española de Bioquímica y Biología Molecular. Bilbao, España. 2008. SEBBM XXXI Congreso Sociedad Española de Bioquímica y Biología Molecular. 169. 169

Ruiz Perez, Jose Francisco, Gómez González, Belén, Aguilera Lopez, Andres:
DSB-Induced Triparental Translocations Mediated by Bir. Comunicación en congreso. Conferences Jacques Monod on Biological Responses to DNA Damage. Roscoff, Francia. 2008. Conferences Jacques Monod on Biological Responses to DNA Damage. 123. 123

Ruiz Perez, Jose Francisco, Gómez González, Belén, Aguilera Lopez, Andres:
Triparental Translocations Generated by Break-Induced Replication. Poster en Congreso. Cnio Cancer Conferences. Links Between Cancer, Replication Stress and Genomic Integrity. 2007. Cnio Cancer Conferences. Links Between Cancer, Replication Stress and Genomic Integrity. 0. 0

Gómez González, Belén, Ruiz Perez, Jose Francisco, Moriel Carretero, Maria, Felipe Abrio, Irene, Aguilera Lopez, Andres:
Transcription and Recombination Mediated Genetic Instability in S. Cerevisiae. Conferencia Congreso no publicada. Cnio Cancer Conferences. Links Between Cancer, Replication Stress and Genomic Integrity. 2007. Cnio Cancer Conferences. Links Between Cancer, Replication Stress and Genomic Integrity. 0. 0

Autor, Otro, Ruiz Perez, Jose Francisco, Autores, Otros, Aguilera Lopez, Andres, Blanco Davila, Luis:
Template Dislocation and Lack of Sugar Discrimination, Two Hallmarks of Human Pol Mu That Likely Specify Its Role in DNA Repair. Comunicación en congreso. Asm Conference on DNA Repair & Mutagenesis: from Molecular Structure to Biological Consequences. Southampton, Bermuda. 2004. Asm Conference on DNA Repair & Mutagenesis: from Molecular Structure to Biological Consequences. 0. 0

Ruiz Perez, Jose Francisco, Autores, Otros, Aguilera Lopez, Andres, Blanco Davila, Luis:
Lack of Sugar Discrimination by Human Pol ¿ Requires a Single Glycine Residue. Comunicación en congreso. Gordon Research Conference on Genetic Toxicology. Oxford, Reino Unido. 2003. Gordon Research Conference on Genetic Toxicology. 0. 0

Autores, Otros, Ruiz Perez, Jose Francisco, Aguilera Lopez, Andres, Al, Et:
Characterization of the Ko Model for DNA Polymerase ¿. Evidence for a Role in the Shm Process. Comunicación en congreso. Gordon Research Conference on Genetic Toxicology. Oxford, Reino Unido. 2003. Gordon Research Conference on Genetic Toxicology. 0. 0

Ruiz Perez, Jose Francisco, Autores, Otros, Aguilera Lopez, Andres, Blanco Davila, Luis:
DNA Polymerase Mu, a Candidate Hypermutase?. Comunicación en congreso. Gordon Research Conference on Genetic Toxicology. 2001. New London, New Hampshire, USA. 2001. Gordon Research Conference on Genetic Toxicology. 0. 0

Ruiz Perez, Jose Francisco, Autores, Otros, Aguilera Lopez, Andres, Blanco Davila, Luis:
DNA Polimerasa Mu (Pol ¿), un Potencial Mutador de DNA en Células Eucariotas. Comunicación en congreso. XXIII Congreso de la Sociedad Española de Bioquimica y Biología Molecular. Granada. 2000. XXIII Congreso de la Sociedad Española de Bioquímica y Biología Molecular (SEBBM). 0. 0

Autores, Otros, Ruiz Perez, Jose Francisco, Autores, Mas, Aguilera Lopez, Andres, Blanco Davila, Luis:
DNA Polimerasa Lambda (Pol L), una Nueva DNA Polimerasa Eucariótica Implicada en Meiosis. Comunicación en congreso. XXIII Congreso de la Sociedad Española de Bioquimica y Biología Molecular. Granada. 2000. XXIII Congreso de la Sociedad Española de Bioquímica y Biología Molecular (SEBBM). 0. 0

Ruiz Perez, Jose Francisco, Autores, Otros, Aguilera Lopez, Andres, Blanco Davila, Luis:
Caracterización de una Nueva DNA Polimerasa Eucariótica, Posiblemente Implicada en Hipermutación Somática. Comunicación en congreso. Congreso de la SEBBM. Pamplona. 1999. XXII Congreso de la Sociedad Española de Bioquimica y Biologia Molecular. 0. 0

Autores, Otros, Ruiz Perez, Jose Francisco, Aguilera Lopez, Andres, Blanco Davila, Luis, Autores, Mas:
DNA Polimerasa Lambda (Pol L) un Nuevo Enzima de Reparación en Células Eucarióticas. Comunicación en congreso. Congreso de la SEBBM. Pamplona. 1999. XXII Congreso de la Sociedad Española de Bioquimica y Biologia Molecular. 0. 0

Ruiz Perez, Jose Francisco:
Regulation of human Pol¿ by post-translational modification. Poster en Congreso

Tesis dirigidas y co-dirigidas:

(Doctorando no grabado)
Polymerases specialized in damage tolerance and DNA double-strand break repair. Tesis Doctoral. 2016