José Francisco Ruiz Pérez
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Perfil en ORCID: 0000-0002-0039-3524
Perfil en WOS: P-2830-2019
Perfil en Scopus: 7401444841
Perfil en Dialnet: 3248618
Otro enlace a Web de investigación: https://grupo.us.es/gomezherreroslab/gomezherreroslab/Home.html

Grupo de Investigación: Expresion Genica en Eucariontes
Departamento/Unidad: Bioquímica Vegetal y Biología Molecular
Situación profesional: Profesor Titular de Universidad

Responsable de los siguientes proyectos/ayudas en la US:

• Proyecto I+D+i:
  • Bases Moleculares de la Formación de Translocaciones Cromosómicas Potencialmente Oncogénicas por Nhej. Papel y Regulación de las Polx Humanas (BFU2013-44343-P)
  • Bases Moleculares de Enfermedades Neurodegenerativas Ligadas a Acumulación Proteica: Papel de la Reparación de Roturas en el ADN (P11-CVI-7948)
  
  
• Ayuda a la investigación:
  • Descifrando nuevas funciones de DNA polimerasas humanas especiallizadas en replicacion y reparacion del DNA (PP2019-13269)
  • Bases moleculares de las translocaciones cromosomicas potencialmente oncogenicas (PP2018-10807)
  • Inestabilidad Genómica Asociada a Roturas en el DNA (PP2017-8488)
  
  

Participa en los siguientes proyectos/ayudas en la US:

• Proyecto I+D+i:
  • Estudio de las bases moleculares de la inestabilidad genómica asociada a las topoisomerasas de DNA (PID2022-137143NB-I00 - Equipo de Investigación)
  • Roturas de ADN Asociadas a Replicación y Reparación por Recombinación de Genomas Eucarióticos (BFU2010-16372 - Investigador)
  • Bases Genéticas y Moleculares del Origen de la Inestabilidad Genomica en Eucariotas (P09-CVI-4567 - Investigador)
  • Inestabilidad genómica (CSD2007-00015 - Investigador)
  • Genómica Funcional de la Interconexión Transcripción -Transporte de ARN (P07-CVI-02549 - Investigador)
  • Bases genéticas y moleculares de la inestabilidad genómica y su relación con la biogénesis de los mRNPs de eucariotas (BFU2006-05260 - Investigador)
  • Bases genéticas y moleculares del origen de la inestabilidad genética en eucariotas (EXC/2005/CVI-624 - Investigador)
  • Collision or progression: DNA replication fork traversal and RNAPII transcription termitation (BIO2003-07172 - Contratado)
  
  
• Ayuda a la investigación:
  • Incentivo al Grupo de Investigación BIO-026 (2017/BIO-026 - Investigador)
  • Incentivo al Grupo de Investigación BIO-102 (2011/BIO-102 - Investigador)
  • Incentivo al Grupo de Investigación BIO-102 (2010/BIO-102 - Investigador)
  • Ayuda a la Consolidación del Grupo de Investigación BIO-102 (2009/BIO-102 - Investigador)
  • Ayuda a la Consolidación del Grupo de Investigación BIO-102 (2008/BIO-102 - Investigador)
  • Ayuda a la Consolidación del Grupo de Investigación BIO-102 (2007/BIO-102 - Investigador)
  • Ayuda a la Consolidación del Grupo de Investigación CVI-102 (2006/CVI-102 - Investigador)
  • Ayuda a la Consolidación del Grupo de Investigación CVI-102 (2005/CVI-102 - Investigador)
  
  

Cobertura de la base de datos de proyectos, véase aqui

Publicaciones:

Capítulos en Libros

Gómez González, Belén, Ruiz Perez, Jose Francisco, Aguilera Lopez, Andres:
Genetic and Molecular Analysis of Mitotic Recombination in Saccharomyces Cerevisiae. Vol. 745. Pag. 151-172. En: DNA Recombination. Methods in Molecular Biology. H. Tsubouchi. 2011

Publicaciones en Revistas

Ruiz Perez, Jose Francisco:
Yra1-bound RNA¿DNA hybrids cause orientation-independent transcription¿ replication collisions and telomere instability. En: Genes & Development. 2018. Vol. 32. Pag. 1-13. http://www.genesdev.org/cgi/doi/10.1101/gad.311274.117.

Ruiz Perez, Jose Francisco:
Pol¿ tumor variants decrease the efficiency and accuracy of NH. En: Nucleic Acids Research. 2017. https://doi.org/10.1093/nar/gkx625

Ruiz Perez, Jose Francisco:
Identificada una nueva vía de regulación en la reparación de roturas de doble cadena en ADN de células humanas. En: Genética Médica News. 2017. Vol. 4. Núm. 76. Pag. 17-19

Muñoz Galvan, Sandra, Garcia Rubio, Maria Luisa, Ortega, Pedro, Ruiz Perez, Jose Francisco, Jimeno Gonzalez, Sonia, et. al.:
A new role for Rrm3 in repair of replication-born DNA breakage by sister chromatid recombination. En: PLoS Genetics. 2017. Vol. 13. Núm. 3

Sastre Moreno, G., Pryor, J.m, Herrero Ruiz, A., Cortes Ledesma, Felipe, Blanco, L., et. al.:
Regulation of human Pol¿ by ATM-mediated phosphorylation during non-homologous end joining. En: DNA Repair. 2017. Vol. 51. Pag. 31-45. doi: 10.1016/j.dnarep.2017.01.004.

Ruiz Perez, Jose Francisco, Pardo, Benjamín, Sastre Moreno, Guillermo, Aguilera Lopez, Andres, Blanco, Luis:
Yeast pol4 promotes tel1-regulated chromosomal translocations. En: PLoS Genetics. 2013. Vol. 9. Núm. 7

Ruiz Perez, Jose Francisco:
Yeast pol4 promotes tel1-regulated chromosomal translocations. En: PLoS Genetics. 2013. Vol. 9. Núm. 7. Pag. 1-14. 10.1371/journal.pgen.1003656

Ruiz Perez, Jose Francisco, Gómez González, Belén, Aguilera Lopez, Andres:
Aid Induces Double-Strand Breaks At Immunoglobulin Switch Regions and C-Myc Causing Chromosomal Translocations in Yeast THO Mutants. En: PLoS Genetics. 2011. Vol. 7. Núm. 2

Ruiz Perez, Jose Francisco, Gómez González, Belén, Aguilera Lopez, Andres:
Chromosomal Translocations Caused by Either Pol32-Dependant or Independant Triparental Break-Induced Replication. En: Molecular and Cellular Biology. 2009. Vol. 29. Núm. 20. Pag. 5441-5454

Autores, Otros, Ruiz Perez, Jose Francisco, Al, Et:
Polymerase is Up-Regulated During the T Cell-Dependent Immune Response and Its Deficiency Alters Developmental Dynamics of Spleen Centroblasts. En: European Journal of Immunology. 2005. Vol. 35. Núm. 5. Pag. 1601-1611

Gonzalez Barrera, Sergio, Autor, Otro, Ruiz Perez, Jose Francisco, Autores, Otros, Blanco Davila, Luis:
Characterization of Sppol4, a Unique X-Family DNA Polymerase in Schizosaccharomyces Pombe. En: Nucleic Acids Research. 2005. Vol. 33. Núm. 15. Pag. 4762-4774

Ruiz Perez, Jose Francisco, Autores, Otros, Piris, Miguel A., Blanco Davila, Luis:
Overexpression of Human DNA Polymerase Mu (Pol Mu) in a Burkitt's Lymphoma Cell Line Affects the Somatic Hypermutation Rate. En: Nucleic Acids Research. 2004. Vol. 32. Núm. 19. Pag. 5861-5873

Autor, Otro, Ruiz Perez, Jose Francisco, Autores, Otros, Blanco Davila, Luis:
Review/Reseña: Are There Mutator Polymerases?. En: The Scientific World Journal. 2003. Vol. 3. Pag. 422-431

Ruiz Perez, Jose Francisco, Al, Et:
?Lack of Sugar Discrimination by Human Pol ? Requires a Single Glycine Residue?. En: Nucleic Acids Research. 2003. Vol. 31. Pag. 4441-4449

Autores, Otros, Ruiz Perez, Jose Francisco, Kunkel, T. A., Blanco Davila, Luis:
DNA Polymerase Lambda, a Novel DNA Repair Enzyme in Human Cells. En: Journal of Biological Chemistry. 2002. Vol. 277. Pag. 13184-13191

Ruiz Perez, Jose Francisco, Autores, Otros, Blanco Davila, Luis:
DNA Polymerase Mu (Pol ?), a Candidate Hypermutase?. En: Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences. 2001. Vol. 356. Pag. 99-109

Autor, Otro, Ruiz Perez, Jose Francisco, Autores, Otros, Blanco Davila, Luis:
DNA Polymerase Mu (), Homologous to Tdt, Could Act As a DNA Mutator in Eukaryotic Cells. En: EMBO Journal. 2000. Vol. 19. Pag. 1731-1742

Autores, Otros, Ruiz Perez, Jose Francisco, Autores, Mas, Blanco Davila, Luis:
DNA Polymerase Lambda (Pol λ ), a Novel Eukaryotic DNA Polymerase With a Potential Role in Meiosis Mammalian Meiotic Polymerase. En: JMB: Journal of Molecular Biology. 2000. Vol. 301. Pag. 851-857

Aportaciones a Congresos

Ruiz Perez, Jose Francisco:
CRISPR-Cas, las herramientas del futuro en Biología. Otras ponencias divulgativas

Muñoz Galvan, Sandra, Garcia Rubio, Maria Luisa, Pardo, Benjamín, Ruiz Perez, Jose Francisco, Gómez González, Belén, et. al.:
New factor involved in recombination-mediated restart of broken forks. Ponencia en Congreso

Ruiz Perez, Jose Francisco:
A role for PolX DNA polymerases in NHEJ-mediated chromosomal translocations. Poster en Congreso

Ruiz Perez, Jose Francisco:
A role for PolX DNA polymerases during NHEJ-mediated chromosomal translocations. Comunicación en Jornada

Ruiz Perez, Jose Francisco:
Yeast PolX DNA polymerase (Pol4) promotes NHEJ-dependent chromosomal translocations after DSBs induction. Poster en Congreso

Ruiz Perez, Jose Francisco:
Analysis of genetic instability in Mouse Embryonic Fibroblasts (MEFs) deficient in Polymerases lambda and mu. Poster en Congreso

Ruiz Perez, Jose Francisco:
DNA-PK-Mediated Phosphorylation of Human Pol Lambda During NHEJ. Ponencia en Congreso

Herrero Ruiz, A., Cortes Ledesma, Felipe, Ruiz Perez, Jose Francisco:
Regulación de la ADN polimerasa lambda humana (Pol¿) mediante SUMOilación durante la reparación del ADN. Poster en Congreso

Ruiz Perez, Jose Francisco:
Regulation of human Pol¿ by post-translational modification. Poster en Congreso

Ruiz Perez, Jose Francisco:
Regulation of human DNA polymerase lambda during NHEJ by ATM-mediated phosphorylation. Poster en Congreso

Ruiz Perez, Jose Francisco:
Regulation of human Pol¿ by post-translational modification. Ponencia en Congreso

Ruiz Perez, Jose Francisco:
Regulación de la ADN polimerasa lambda humana (Pol¿) durante la reparación de DSBs or NHEJ mediante fosforilación dependiente de DNA-PKcs. Ponencia en Congreso

Ruiz Perez, Jose Francisco:
Regulation of human DNA polymerase lambda during NHEJ by DNA-PK-mediated phosphorylation. Comunicación en congreso

Ruiz Perez, Jose Francisco, Autores, Otros, Aguilera Lopez, Andres, Blanco Davila, Luis:
Caracterizaci?N de una Nueva DNA Polimerasa Eucari?Tica, Posiblemente Implicada en Hipermutaci?N Som?Tica. Comunicación en congreso. XXII Congreso de la Sociedad Espa?Ola de Bioquimica y Biologia Molecular. 0. 0

Autores, Otros, Ruiz Perez, Jose Francisco, Aguilera Lopez, Andres, Blanco Davila, Luis, Autores, Mas:
DNA Polimerasa Lambda (Pol L) un Nuevo Enzima de Reparaci?N en C?Lulas Eucari?Ticas. Comunicación en congreso. XXII Congreso de la Sociedad Espa?Ola de Bioquimica y Biologia Molecular. 0. 0

Ruiz Perez, Jose Francisco, Autores, Otros, Aguilera Lopez, Andres, Blanco Davila, Luis:
DNA Polimerasa Mu (Pol ?), un Potencial Mutador de DNA en C?Lulas Eucariotas. Comunicación en congreso. XXIII Congreso de la Sociedad Espa?Ola de Bioqu?Mica y Biolog?a Molecular (SEBBM). 0. 0

Autores, Otros, Ruiz Perez, Jose Francisco, Autores, Mas, Aguilera Lopez, Andres, Blanco Davila, Luis:
DNA Polimerasa Lambda (Pol L), una Nueva DNA Polimerasa Eucari?Tica Implicada en Meiosis. Comunicación en congreso. XXIII Congreso de la Sociedad Espa?Ola de Bioqu?Mica y Biolog?a Molecular (SEBBM). 0. 0

Ruiz Perez, Jose Francisco, Autores, Otros, Aguilera Lopez, Andres, Blanco Davila, Luis:
DNA Polymerase Mu, a Candidate Hypermutase?. Comunicación en congreso. Gordon Research Conference on Genetic Toxicology. 0. 0

Ruiz Perez, Jose Francisco, Autores, Otros, Aguilera Lopez, Andres, Blanco Davila, Luis:
Lack of Sugar Discrimination by Human Pol ? Requires a Single Glycine Residue. Comunicación en congreso. Gordon Research Conference on Genetic Toxicology. 0. 0

Autores, Otros, Ruiz Perez, Jose Francisco, Aguilera Lopez, Andres, Al, Et:
Characterization of the Ko Model for DNA Polymerase ?. Evidence for a Role in the Shm Process. Comunicación en congreso. Gordon Research Conference on Genetic Toxicology. 0. 0

Autor, Otro, Ruiz Perez, Jose Francisco, Autores, Otros, Aguilera Lopez, Andres, Blanco Davila, Luis:
Template Dislocation and Lack of Sugar Discrimination, Two Hallmarks of Human Pol Mu That Likely Specify Its Role in DNA Repair. Comunicación en congreso. Asm Conference on DNA Repair & Mutagenesis: from Molecular Structure to Biological Consequences. 0. 0

Ruiz Perez, Jose Francisco, Gómez González, Belén, Aguilera Lopez, Andres:
Triparental Translocations Generated by Break-Induced Replication. Poster en Congreso. Cnio Cancer Conferences. Links Between Cancer, Replication Stress and Genomic Integrity. 0. 0

Gómez González, Belén, Ruiz Perez, Jose Francisco, Moriel Carretero, Maria, Felipe Abrio, Irene, Aguilera Lopez, Andres:
Transcription and Recombination Mediated Genetic Instability in S. Cerevisiae. Conferencia Congreso no publicada. Cnio Cancer Conferences. Links Between Cancer, Replication Stress and Genomic Integrity. 0. 0

Ruiz Perez, Jose Francisco, Aguilera Lopez, Andres:
DSB-Induced Chromosomal Rearrangements. Conferencia Congreso no publicada. Embo Conference Series on Recombination Mechanism. 0. 0

Gavaldá Martín, Sandra, Ruiz Perez, Jose Francisco, Aguilera Lopez, Andres:
Analysis of Replication Fork Collisions With the Transcription Machinery. Comunicación en congreso. SEBBM XXXI Congreso Sociedad Espa?Ola de Bioqu?Mica y Biolog?a Molecular. 169. 169

Ruiz Perez, Jose Francisco, Gómez González, Belén, Aguilera Lopez, Andres:
DSB-Induced Triparental Translocations Mediated by Bir. Comunicación en congreso. Conferences Jacques Monod on Biological Responses to DNA Damage. 123. 123

Ruiz Perez, Jose Francisco, Gómez González, Belén, Aguilera Lopez, Andres:
R-Loop Dependant Transcription Impairment Can Result in Dsbs and Chromosomal Translocations in Yeast. Poster en Congreso. Embo Conference Series on Recombination and Connections to Sumo and Ubiquitin Modifications. 0. 0

Tesis dirigidas y co-dirigidas:

(Doctorando no grabado)
Polymerases specialized in damage tolerance and DNA double-strand break repair. Tesis Doctoral. 2016