Logotipo de Universidad de Sevilla
VICERRECTORADO DE INVESTIGACIÓN
Logotipo Andalucía Tech
Letras Universidad de Sevilla

Ficha personal - Antonio Marín Rodríguez


Antonio Marín Rodríguez
Telefono: 954557113
Email: Solicitar correo

Grupo de Investigación: BIO-162 Genomica Evolutiva y Bioinformatica
Departamento/Unidad: Genética
Situación profesional: Personal Docente Jubilado

Responsable de los siguientes proyectos/ayudas en la US:

  • Proyecto de investigación:
    • Genómica evolutiva del sistema mutación/selección contra la citosina en las bacterias (BFU2007-60791)
    • Reconocimiento de regiones funcionales en el ADN: análisis de las relaciones entre composición nucleotida y la estructura de los genes (BIO99-0651-C02-02)

  • Ayuda a la investigación:
    • Incentivo al Grupo de Investigación BIO-162 (2011/BIO-162)
    • Incentivo al Grupo de Investigación BIO-162 (2010/BIO-162)
    • Ayuda a la Consolidación del Grupo de Investigación BIO-162 (2009/BIO-162)
    • Ayuda a la Consolidación del Grupo de Investigación BIO-162 (2008/BIO-162)
    • Ayuda a la Consolidación del Grupo de Investigación BIO-162 (2007/BIO-162)
    • Ayuda a la Consolidación del Grupo de Investigación CVI-162 (2005/CVI-162)
    • Ayuda a la Consolidación del Grupo de Investigación CVI-162 (2003/CVI-162)
    • Financiar la Red Temática de Bioinformática de Andalucía (RTBA) (ACC2003/CVI-162)
    • Acciones coordinadas del grupo CVI-162 (ACC-468-CVI-2001)
    • Ayuda a la Consolidación del Grupo de Investigación CVI-162 (2000/CVI-162)
    • Ayuda a la Consolidación del Grupo de Investigación CVI-162 (1997/CVI-162)

Participa en los siguientes proyectos/ayudas en la US:

  • Proyecto de investigación:
    • R-loops as a major modulator of transcription-associated recombination and chromatin dynamics (TARLOOP) (2628/0721 - Equipo Trabajo (Solicitud))
    • Inestabilidad Genómica Asociada a Transcripción e Híbridos DNA-RNA (BFU2013-42918-P - Equipo Trabajo (Solicitud))
    • El Complejo Mad y la Regulación de la Transcripción por la Luz en el Hongo Phycomyces Blakesleeanus (P09-CVI-5027 - Investigador)
    • Inestabilidad genómica (CSD2007-00015 - Investigador)
    • Análisis informático y molecular del genoma y del transcriptoma del hongo cigomiceto Phycomyces blakesleeanus (P06-CVI-01650 - Investigador)
    • Saccharomyces cerevisiae como modelo eucariótico para el estudio genómico y proteómico de la respuesta celular al estres (GEN2001-4707-C08-02 - Investigador)

  • Ayuda a la investigación:
    • Secuenciación del genoma del hongo phycoyces blakesleeanus: gestión del proyecto y anotación manual del genona (BIO2005-25029-E - Investigador)

Cobertura de la base de datos de proyectos, véase aqui


Publicaciones:

Capítulos en Libros
Gutierrez Pozo, Gabriel, Marin Rodriguez, Antonio:
Hominización. Pag. 29-47. En: Bases Biológicas, Lingüísticas, Lógicas y Computacionales para la Concepción de la Mente : Llic-S-2004-01. Mergablum Edición y Comunicación. 2004. ISBN 84-96378-04-7

Gutierrez Pozo, Gabriel, Marin Rodriguez, Antonio:
La Información Genética. Pag. 231-250. En: Información: Tratamiento y Representación. Secretariado de Publicaciones. 2001. ISBN 84-472-0692-0

Oliver Jimenez, Jose L., Marin Rodriguez, Antonio, Martínez Zapater, José Miguel:
Maize Chloroplast Gene Transfer to Nucleus. Vol. 25. Pag. 431-444. En: Biotechnology in Agriculture and Forestry. New York, USA. Springer-Verlag. Nueva York. 1994. ISBN 3-540-56392-X

Marin Rodriguez, Antonio, Gutierrez Pozo, Gabriel, Oliver Jimenez, Jose L.:
Uso de Codones y Preferencias de Dinucleótidos: un Estudio de las Diferencias de Composición Dentro del Genomio Humano. Pag. 185-197. En: Biología Computacional. Valencia, España. Publicaciones de la Universidad de Valencia. 1994

Marin Rodriguez, Antonio, Corrochano Pelaez, Luis Maria, Medina Precioso, Juan Ramón:
Aspectos Evolutivos de los Pseudogenes. Pag. 189-199. En: Genética. Ceura-Madrid. 1989. ISBN 84-87191-11-8

Publicaciones en Revistas
Santos Pereira, José María, Herrero, Ab, Garcia Rubio, Maria Luisa, Marin Rodriguez, Antonio, Moreno, Sergio, et. al.:
The Npl3 hnRNP prevents R-loop-mediated transcription-replication conflicts and genome instability. En: Genes & Development. 2013. Vol. 27. Núm. 22. Pag. 2445-2458

Gómez González, Belén, Garcia Rubio, Maria Luisa, Bermejo, R, Gaillard, Helene, Shirahige, K, et. al.:
Genome-Wide Function of THO/TREX in Active Genes Prevents R-Loop-Dependent Replication Obstacles. En: EMBO Journal. 2011. Vol. 30. Núm. 15. Pag. 3106-3119

Jimeno Gonzalez, Sonia, Garcia Rubio, Maria Luisa, Ranes, Michael, González Aguilera, Cristina, Marin Rodriguez, Antonio, et. al.:
New Suppressors of THO Mutations Identify Thp3 (Ypr045c)-Csn12 As a Protein Complex Involved in Transcription Elongation. En: Molecular and Cellular Biology. 2011. Vol. 31. Núm. 4. Pag. 674-685

Gaillard, Helene, Tous Rivera, Cristina, Botet, J, González Aguilera, Cristina, Quintero, M J, et. al.:
Genome-Wide Analysis of Factors Affecting Transcription Elongation and DNA Repair: a New Role for Paf and Ccr4-Not in Transcription-Coupled Repair. En: PLoS Genetics. 2009. Vol. 5. Núm. 2

Lopez Domingo, Francisco Javier, Blanco Moron, Armando, Garcia Alcalde, Fernando, Cano Gutierrez, Carlos, Marin Rodriguez, Antonio:
Fuzzy Association Rules for Biological Data Analysis: a Case Study on Yeast. En: BMC Bioinformatics. 2008. Vol. 9. Núm. 107. Pag. 1-18

Marin Rodriguez, Antonio, Xia, Xuhua:
Gc Skew in Protein-Coding Genes Between the Leading and Lagging Strands in Bacterial Genomes: New Substitution Models Incorporating Strand Bias. En: Journal of Theoretical Biology. 2008. Vol. 253. Núm. 3. Pag. 508-513

Wang, Magnus, Marin Rodriguez, Antonio:
Characterization and Prediction of Alternative Splice Sites. En: Gene. 2006. Vol. 366. Núm. 2. Pag. 219-227

Ganfornina, María Dolores, Pérez García, M.T., Gutierrez Pozo, Gabriel, Miguel Velado, E., López López, J.R., et. al.:
Comparative Gene Expression Profile of Mouse Carotid Body and Adrenal Medulla Under Physiological Hypoxia. En: The Journal of Physiology. 2005. Vol. 566. Núm. 2. Pag. 491-503

Marin Rodriguez, Antonio, Wang, Magnus F., Gutierrez Pozo, Gabriel:
Short-Range Compositional Correlation in the Yeast Genome Depends on Transcriptional Orientation. En: Gene. 2004. Vol. 333. Pag. 151-155

Marin Rodriguez, Antonio, Gallardo, M., Kato, y, Shirahige, K, Gutierrez Pozo, Gabriel, et. al.:
Relationship Between G+c Content, Orf-Length and Mrna Concentration in Saccharomyces Cerevisiae. En: Yeast. 2003. Vol. 20. Núm. 8. Pag. 703-711

Sánchez, Diego, Ganfornina, María Dolores, Gutierrez Pozo, Gabriel, Marin Rodriguez, Antonio:
Exon-Intron Structure and Evolution of the Lipocalin Gene Family. En: Molecular Biology and Evolution. 2003. Vol. 20. Núm. 5. Pag. 775-783

Marin Rodriguez, Antonio, Oliver Jimenez, Jose L.:
Gc-Biased Mutation Pressure and Orf Lengthening. En: Journal of Molecular Evolution. 2003. Vol. 56. Núm. 3. Pag. 371-372

Gutierrez Pozo, Gabriel, Sánchez, Diego, Marin Rodriguez, Antonio:
A Reanalysis of the Ancient Mitochondrial DNA Sequences Recovered from Neandertal Bones. En: Molecular Biology and Evolution. 2002. Vol. 19. Núm. 8. Pag. 1359-1366

Marin Rodriguez, Antonio:
El Proyecto Genoma. En: Revista de Libros. 2000. Vol. 46. Pag. 32-33

Marin Rodriguez, Antonio, Gutierrez Pozo, Gabriel, Oliver Jimenez, Jose L.:
Compositional Correlation Between Open Reading Frames With Opposite Transcriptional Orientations in Escherichia Coli. En: Journal of Molecular Evolution. 1999. Vol. 48. Núm. 6. Pag. 712-716

Marin Rodriguez, Antonio, Dorado Perez, Gabriel, González Martin Montalbo,Francisco, Gutierrez Pozo, Gabriel, Oliver Jimenez, Jose L.:
Letters: Scientific Correspondence on Moriyama and Powell¿S Gene Length and Codon Usage Bias in Drosophila Melanogaster, Saccharomyces Cerevisiae and Escherichia Coli. En: Nucleic Acids Research. 1998. Vol. 26. Núm. 19. Pag. 4540-4540

Gutierrez Pozo, Gabriel, Marin Rodriguez, Antonio:
The Most Ancient DNA Recovered from an Amber-Preserved Specimen May Not Be As Ancient As It Seems. En: Molecular Biology and Evolution. 1998. Vol. 15. Núm. 7. Pag. 926-929

Gutierrez Pozo, Gabriel, Casadesus Pursals, Josep, Oliver Jimenez, Jose L., Marin Rodriguez, Antonio:
Letters: A Possible Relationship Between Vsp Mismatch Repair and Gene Expression Level. En: Journal of Molecular Evolution. 1996. Vol. 43. Núm. 2. Pag. 161-163

Gutierrez Pozo, Gabriel, Márquez Rodríguez, Lorenzo, Marin Rodriguez, Antonio:
Preference for Guanosine At First Codon Position in Highly Expressed Escherichia Coli Genes. a Relationship With Translational Efficiency. En: Nucleic Acids Research. 1996. Vol. 24. Núm. 13. Pag. 2525-2527

Oliver Jimenez, Jose L., Marin Rodriguez, Antonio:
A Relationship Between Gc Content and Coding-Sequence Length. En: Journal of Molecular Evolution. 1996. Vol. 43. Núm. 3. Pag. 216-223

Gutierrez Pozo, Gabriel, Oliver Jimenez, Jose L., Marin Rodriguez, Antonio:
Letters: On the Origin of the Periodicity of 3 in Protein-Coding DNA-Sequences. En: Journal of Theoretical Biology. 1994. Vol. 167. Núm. 4. Pag. 413-414

Marin Rodriguez, Antonio, Oliver Jimenez, Jose L., Medina, Juan Ramón:
El Llenguatge Dels Gens: Ús de Codons en Gens de Vertebrats. En: Treballs de la Societat Catalana de Biologia. 1994. Vol. 45. Pag. 55-67

Gutierrez Pozo, Gabriel, Oliver Jimenez, Jose L., Marin Rodriguez, Antonio:
Dinucleotides and G+c Content in Human Genes - Opposite Behavior of Gpg, GPC, and Tpc At II-III Codon Positions and in Introns. En: Journal of Molecular Evolution. 1993. Vol. 37. Núm. 2. Pag. 131-136

Martínez Zapater, José Miguel, Marin Rodriguez, Antonio, Oliver Jimenez, Jose L.:
Evolution of Base Composition in T-DNA Genes from Agrobacterium. En: Molecular Biology and Evolution. 1993. Vol. 10. Núm. 2. Pag. 437-448

Rodríguez Mateos,Francisco, Oliver Jimenez, Jose L., Marin Rodriguez, Antonio, Medina Precioso, Juan Ramón:
The General Stochastic Model of Nucleotide Substitution. En: Journal of Theoretical Biology. 1990. Vol. 142. Pag. 485-501

Oliver Jimenez, Jose L., Marin Rodriguez, Antonio, Martínez Zapater, José Miguel:
Chloroplast Genes Transferred to the Nuclear Plant Genome Have Adjusted to Nuclear Base Compositiion and Codon Usage. En: Nucleic Acids Research. 1990. Vol. 18. Pag. 65-72

Marin Rodriguez, Antonio, Medina Precioso, Juan Ramón:
On the Effective Neutral Mutation Rate. En: Evolucio¿n Biolo¿gica. Revista Internacional de la Asociacio¿n Iberoamericana de Biologi¿a Evolutiva.. 1989. Vol. 3. Pag. 405-408

Oliver Jimenez, Jose L., Marin Rodriguez, Antonio, Medina, Juan Ramón:
Sdse: a Software Package to Simulate the Evolution of a Pair of DNA Sequences. En: Computer Applications in the Biosciences. 1989. Vol. 5. Pag. 47-50

Marin Rodriguez, Antonio, Bertranpetit Busquets,Jaume, Oliver Jimenez, Jose L., Medina Precioso, Juan Ramón:
Variation in G+c Content and Codon Choice: Differences Among Synonymous Codon Groups in Vertebrate Genes. En: Nucleic Acids Research. 1989. Vol. 17. Pag. 6181-6189

Oliver Jimenez, Jose L., Marin Rodriguez, Antonio, Amils Pibernat, Ricardo:
Inferring the Phylogeny of Archaebacteria: the Use of Ribosomal Sensitivity to Protein Synthesis Inhibitors. En: Journal of Molecular Evolution. 1987. Vol. 24. Pag. 281-288

Marin Rodriguez, Antonio, Corrochano Pelaez, Luis Maria, Medina Precioso, Juan Ramón:
On the Evolutionary Rate of Pseudogenes. En: Genética Ibérica. 1987. Vol. 39. Pag. 389-396

Clegg, E. J., Tills, D., Warlow, a, Wilkinson, J., Marin Rodriguez, Antonio:
Blood Group Variation in the Isle of Lewis. En: Annals of Human Biology. 1985. Vol. 12. Núm. 4. Pag. 345-361

Tills, D., Harvey, R. G., Warlow, a, Kopec, A. C., Suter, D., et. al.:
Bloog Groups, Serum Proteins and Enzymes of the Faroe Islanders. En: Journal of Human Evolution. 1985. Vol. 14. Pag. 725-738

Tills, D., Kopec, A. C., Warlow, a, Barnicot, N. A., Mourant, A. E., et. al.:
Blood Group, Protein, and Red Cell Enzyme Polymorphisms of the Hadza of Tanzania. En: Excerpta Medica. Section 22: Human Genetics. 1982. Vol. 61. Núm. 1. Pag. 52-59

Mitchell, R. J., Tills, D., Warlow, a, Kopec, A. C., Sunderland, e, et. al.:
Genetic Studies of the Population of the Isle of Man. En: Annals of Human Biology. 1982. Vol. 9. Núm. 1. Pag. 57-68

Aportaciones a Congresos
Santos Pereira, José María, Herrero, Ab, Garcia Rubio, Maria Luisa, Marin Rodriguez, Antonio, Moreno, Sergio, et. al.:
A new role for NpI3 hnRNP preventing genome instability. Poster en Congreso. UNIA ¿ The regulatory roles of ncRNA. Baeza, España. 2013

Tous Rivera, Cristina, Marin Rodriguez, Antonio, Aguilera Lopez, Andres:
A Comparative Genome-Wide Expression Analysis of THO/TREX Conditional Mutants. Comunicación en congreso. RNA Quality Control Conference. Granada. 2008. European Science Foundation. 0. 0

Corrochano Pelaez, Luis Maria, Gutierrez, G., Gutierrez Pozo, Gabriel, Marin Rodriguez, Antonio, Rodriguez Romero, Julio Luis, et. al.:
El Genoma del Hongo Zigomiceto Phycomyces Blakesleeanus. Conferencia Congreso no publicada. XXXVI Congreso de la Sociedad Expañola de Genética. León. 2007. XXXVI Congreso de la Sociedad Española de Genética. 301. 301

Blanco Moron, Armando, Garcia Alcalde, Fernando, Marin Rodriguez, Antonio:
Extracting Biological Knowledge by Fuzzy Association Rule Mining. Comunicación en congreso. 2007 IEEE International Conference on Fuzzy Systems. Londres (Reino Unido). 2007. Proceedings of the 2007 IEEE International Conference on Fuzzy Systems. 1. 6

Mateos García, Daniel, Riquelme Santos, José Cristóbal, Aguilar Ruiz, Jesus Salvador, Marin Rodriguez, Antonio:
Segmentación Evolutiva del Genoma de la Levadura. Comunicación en congreso. Asociación Española para la Inteligencia Artificial. Conferencia. San Sebastián. 2003. CAEPIA-TTIA 2003. X Conferencia de la Asocicación Española para la Inteligenciia Artificial. 227. 230

Ganfornina, María Dolores, Sánchez, Diego, Gutierrez Pozo, Gabriel, Marin Rodriguez, Antonio:
Molecular Evolution of the Lipocalin Family. Comunicación en congreso. Benzon Symposium No. 50. the Lipocalin Protein Superfamily. Copenhagen, Dinamarca. 2003. Benzon Symposium the Lipocalin Protein Superfamily. 6. 6

Marin Rodriguez, Antonio, Wang, Magnus, Gutierrez Pozo, Gabriel:
Compositional Correlation and Transcriptional Orientation in the Yeast Genome. Poster en Congreso. IV Jornadas de Bioinformática. A Coruña, España. 2003. Actas de las IV Jornadas de Bioinformática. 97. 99

Oliver Jimenez, Jose L., Gutierrez Pozo, Gabriel, Mejias Romero, Andres, Marin Rodriguez, Antonio, Iañez Pareja, Enrique:
Organizacion de las Orfs en el Cromosoma Bacteriano. Poster en Congreso. Nuevas Perspectivas en la Intervencion Psicopedagogica: II. Orientacion, Educaion Especial y Formacion del Profesorado. 2002. XXV Reunión de la Asociación Española de Ciencia Regional. 0. 0

Marin Rodriguez, Antonio, Gutierrez Pozo, Gabriel, Zimmerly, Steven:
Compositional Characteristics of Group II Intron Orfs. Poster en Congreso. II Jornadas de Bioinformática. , Málaga, España. 2001. Actas de las II Jornadas de Bioinformática. 315. 315

Tesis dirigidas y co-dirigidas:


Lopez Domingo, Francisco Javier:
Integración y análisis de datos genómicos mediante patrones difusos: Aplicaciones. Tesis Doctoral. 2010

Gutierrez Pozo, Gabriel:
Sesgos Mutacionales y Composición del ADN. Tesis Doctoral. 1994

Vicerrectorado de Investigación. Universidad de Sevilla. Pabellón de Brasil. Paseo de las Delicias s/n. Sevilla